Terlahir dengan nama Muhammad Yusuf, Syech Yusuf lahir dari pasangan Abdullah dan Aminah pada tanggal 03 Juli 1626.Sedangkan nama Muhammad Yusuf merupakan pemberian dari raja Gowa ( Sultan Alauddin ). Menuntut ilmu agama dari guru ke guru dilakoni Syekh Yusuf, mulai dari Daeng Ri Tassamang, guru kerajaan Gowa pada usia 15 tahun, saat itu juga berguru dengan Sayyid Ba-lawi bin Abdul Al-Allamah Attahir dan Sayyid Jalaludin Al-Aidid. Pernah juga berguru dengan Syekh Nuruddin Ar-Raniri dan mendalami tarekat Qodiriyah. Berguru di negeri Yaman pun dijalani. Saat itu Syekh Yusuf berguru dengan Syekh Abdullah Muhammad bin Abd Al-Baqi hingga ke Damaskus dengan Syekh Abu Al-Barakat Ayyub bin Ahmad bin Ayyub Al-Khalwati Al-Quraisyi. Syekh Yusuf menikah dengan putri Sultan Gowa dan sempat pindah ke Banten setelah Kesultanan Gowa kalah perang terhadap Belanda. Kemudian menjadi mufti di Banten. Dengan hadirnya Syekh Yusuf di Banten, menjadikan Banten merupakan pusat pendidikan agama Islam. Tapi sayangnya Syekh Yusuf tertangkap dan diasingkan di Srilanka oleh pasukan Belanda pada tahun 1684, setelah kekalahan pasukan Sultan Ageng pada tahun 1682. Diasingkannya Syekh Yusuf di Srilanka tidak pernah mengurungkan niatnya untuk menyebarkan agama Islam. Dakwah di Srilanka sekan akan menjadikan Syekh Yusuf menjadi sosok seorang tokoh yang mudah diterima masyarakat. Ratusan murid didapatkan dan kebanyakan dari India Selatan. Hal ini diketahui oleh Belanda,sehingga Belanda mulai memikirkan siasat lagi untuk dipindahkan ke negara lain.Afrika Selatan menjadi tempat baru bagi Syekh Yusuf karena lokasinya sangat jauh. Hijrahlah Syekh Yusuf di Afrika Selatan pada tahun 1693. Tak jauh beda dengan India, negara ini juga merupakan negara yang juga menerima hadirnya Syekh Yusuf sebagai seorang Da'i besar. Hingga mantan presiden Nelson Mandela pun menyebut Syekh Yusuf sebagai Salah Seorang Putra Afrika Terbaik. Di negara inilah Syekh Yusuf akhirnya meninggal pada tanggal 23 Mei 1699.